Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA3O96018 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA3O96018 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA3O96018 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA3O96018 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA3O96018 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APBA3O96018 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APBA3O96018 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APBA3O96018 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APBA3O96018 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APBA3O96018 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APBA3O96018 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APBA3O96018 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APBA3O96018 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APBA3O96018 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA3O96018 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA3O96018 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA3O96018 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA3O96018 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APBA3O96018 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms