Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTL6BO94805 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms