Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSO75390 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSO75390 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSO75390 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSO75390 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSO75390 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSO75390 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSO75390 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSO75390 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSO75390 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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