Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF253O75346 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms