Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEMFO60524 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEMFO60524 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEMFO60524 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEMFO60524 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms