Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DENRO43583 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DENRO43583 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DENRO43583 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DENRO43583 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms