Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms