Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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