Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KPNA3O00505 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KPNA3O00505 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms