Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AGRNO00468 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms