Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms