Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
E9PCH4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
E9PCH4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
E9PCH4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
E9PCH4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
E9PCH4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
E9PCH4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
E9PCH4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
E9PCH4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
E9PCH4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
E9PCH4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
E9PCH4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
E9PCH4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
E9PCH4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
E9PCH4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
E9PCH4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms