Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E9PBE3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E9PBE3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E9PBE3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E9PBE3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms