Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
B4DXG7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4DXG7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4DXG7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DXG7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DXG7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DXG7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DXG7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DXG7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DXG7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DXG7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4DXG7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4DXG7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms