Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGPD3A6NKT7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms