Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM247A6NEH6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM247A6NEH6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms