Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYCE3A1L190 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms