Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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SMCO1Q147U7 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SMCO1Q147U7 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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