Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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RFTN1Q14699 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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RFTN1Q14699 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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RFTN1Q14699 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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