Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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