Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL136528.2-201ENST00000416554 351 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CCDC144NL-AS1-202ENST00000423473 839 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL391987.3-201ENST00000441101 719 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC073188.1-201ENST00000442493 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC003666.1-201ENST00000454113 611 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC244505.1-201ENST00000502642 307 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SRD5A3-AS1-202ENST00000510637 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC010319.1-201ENST00000526892 1258 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC005186.1-201ENST00000534849 570 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CACNA1C-AS3-201ENST00000543559 444 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC124248.1-201ENST00000558221 402 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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ANKRD39Q53RE8 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RN7SL140P-201ENST00000581321 294 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MIR4440-201ENST00000583986 98 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 DMKN-268ENST00000602781 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FAM205C-202ENST00000603592 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL122127.1-201ENST00000603832 327 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL731556.2-201ENST00000615610 770 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL137798.3-201ENST00000639399 166 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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