Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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ZNF56Q15929 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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ZNF56Q15929 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF56Q15929 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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ZNF56Q15929 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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