Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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CHAF1AQ13111 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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CHAF1AQ13111 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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CHAF1AQ13111 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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CHAF1AQ13111 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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CHAF1AQ13111 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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CHAF1AQ13111 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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