Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC215522.1-201ENST00000615488 446 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 HLA-B-258ENST00000640615 240 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CEP63-202ENST00000337090 5632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RRN3-201ENST00000198767 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL137145.2-201ENST00000399868 3086 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AP003025.2-202ENST00000414466 4335 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 DCLRE1C-204ENST00000378246 2637 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LINC00486-201ENST00000414054 1794 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CYP4A11-204ENST00000462347 1775 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL353898.3-201ENST00000624679 1755 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SIDT2-219ENST00000620360 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC055716.2-201ENST00000552545 2441 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ADGRF4-201ENST00000283303 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 IL37-205ENST00000353225 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 IGLV3-1-201ENST00000390319 398 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RPL36P2-201ENST00000426026 315 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC084017.1-201ENST00000483240 860 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 PAX8-211ENST00000497038 816 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC010368.1-201ENST00000510160 456 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LINC00967-202ENST00000517725 259 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL049634.2-203ENST00000564763 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ULK4P3-202ENST00000565158 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 TTC39A-AS1-202ENST00000568425 554 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ZNF213-AS1-208ENST00000575139 530 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC003098.1-201ENST00000591540 494 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 uc_338.2-201ENST00000612963 182 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 MIR7113-201ENST00000621222 59 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 TTC14-201ENST00000296015 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 PTK2-203ENST00000430260 1940 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ZNF35-202ENST00000396056 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ABHD18-201ENST00000388795 5450 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SLC24A2-201ENST00000286344 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 GYG2-209ENST00000639373 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 FAM182A-201ENST00000376398 5070 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 PARP11-204ENST00000447133 4377 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 HSPA9P1-201ENST00000432228 2029 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ADAM2-202ENST00000347580 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 TTTY6-201ENST00000253838 491 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 TTTY6B-201ENST00000253848 491 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RNA5SP74-201ENST00000363538 109 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC006455.7-201ENST00000422502 392 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RN7SL761P-201ENST00000463259 278 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RN7SL700P-201ENST00000496982 294 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 HSPD1P18-201ENST00000504252 244 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LINC00681-201ENST00000530150 504 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC006927.1-201ENST00000544818 498 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 OR7E159P-201ENST00000553761 298 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC005779.1-201ENST00000591569 540 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms