Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CEP290O15078 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CEP290O15078 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CEP290O15078 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CEP290O15078 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CEP290O15078 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CEP290O15078 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CEP290O15078 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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