Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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