Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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