Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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