Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FAM187BQ17R55 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms