Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms