Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DNASE1L3Q13609 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms