Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD4-204ENST00000526005 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 JADE1-211ENST00000512960 3000 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF133-214ENST00000628216 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IL16-203ENST00000394652 2397 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNDC16-201ENST00000281741 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NETO2-201ENST00000303155 3241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMLHE-201ENST00000334398 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FYN-203ENST00000368667 2416 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms