Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDK4Q16654 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDK4Q16654 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDK4Q16654 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms