Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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