Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ANKRD42Q8N9B4 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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