Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRMP28827 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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