Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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