Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 SLFN13-210ENST00000534689 3058 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AP001528.3-201ENST00000624364 3249 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 HEPACAM2-203ENST00000440868 2060 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 NUTF2P4-201ENST00000458353 381 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC010368.1-201ENST00000510160 456 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 LINC02318-202ENST00000556346 715 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 SLC28A2-201ENST00000347644 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CAMK2BQ13554 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 RFX3-202ENST00000358730 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 KLHL32-205ENST00000539200 3600 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 NCKAP1L-202ENST00000545638 3612 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 NXPE3-207ENST00000616286 1832 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 AL049758.1-201ENST00000423154 397 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CAMK2BQ13554 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms