Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
RTL8BQ17RB0 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms