Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms