Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RIPOR2-205ENST00000510784 3381 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 FBXO36-202ENST00000373652 3120 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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