Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A3GALT2U3KPV4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
A3GALT2U3KPV4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms