Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAP3K4Q9Y6R4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms