Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms