Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRBQ9Y5M8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms