Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG6Q9Y2V7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COG6Q9Y2V7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms