Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms