Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNND2Q9UQB3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNND2Q9UQB3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms