Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAK1Q9UPV9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms