Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LHX6Q9UPM6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms